臺北市中正區南門國民小學自西元一九○五年創校至今，已屆百餘年，期間曾因臺灣光復、日人遣返且臺灣省警察學校借用而中斷20餘年。民國五十七年實施九年國民義務教育，臺北市政府從警察學校手中收回校地，成立南門國中，建校於小學預定地（廣州街六號）之校園南半邊，民國五十八年，南門國小復校於校地之北側，嗣後二十年間由南門國中校長兼任國小校長，直至七十八年八月王文浩校長接任，是南門國小第一任獨立校長；八十三年八月周瑞雲女士任第二任小學校長；八十六年八月張清楚先生任第三任校長；九十七年八月洪國本先生任第四任校長；一○二年八月李嗣蕙女士任第五任校長；現任校長為張秀潔校長。 　　南門國小位於中正博愛特區，捷運小南門站設置於旁，與法院、法務部、出入境管理局、和平醫院、南海學園、龍山寺、中正紀念堂為鄰，與南門國中連體，有著豐富的社會資源，積極營造優質的學校文化氛圍，朝人性化、精緻化的教育理想邁進，期能共同經營安全、健康、充實、成長、快樂的學習環境。